Αγαπητέ χρήστη, παρατηρήσαμε οτι έχεις ενεργοποιημένο Ad Blocker.
Για την καλύτερη εμπειρία σου θα θέλαμε να σε παρακαλέσουμε να το απενεργοποιήσεις κατά την πλοήγησή σου στο site μας ή να προσθέσεις το enternity.gr στις εξαιρέσεις του Ad Blocker.
Με εκτίμηση, Η ομάδα του Enternity

Τα video games, κλειδί για τη σύγχρονη επιστήμη - Σελίδα 2

Tου Μανώλη Παπακωνσταντίνου
Υπ.
Διδάκτωρ Φαρμακογενετικής Ιατρικής Σχολής Αθηνών


Στη μύγα των φρούτων (drosophila melanogaster) υπάρχουν τρία γονίδια, τα οποία συμμετέχουν στο σχηματισμό του σώματος και των οργάνων της. Αν αυτά τα γονίδια μεταλλαχτούν και δεν είναι λειτουργικά, τα έμβρυα τότε εμφανίζουν μικρά «δοντάκια» και μοιάζουν με σκαντζόχοιρους. Το ένα από τα τρία γονίδια λέγεται Sonic Hedgehog. Ναι, Sonic Hedgehog, γιατί ο τύπος που το βρήκε, όντας gamer του θύμισε τον αγαπημένο σκαντζόχοιρο της SEGA και το βάφτισε έτσι. Και όλοι οι συνάδελφοι του τον συνεχάρησαν γιατί ήταν κι αυτοί gamers και γενικά η κίνηση του ήταν πολύ καλή γιατί βοήθησε κι εμάς όταν ήμαστε φοιτητές να θυμόμαστε μέσα σε όλες τις άχρηστες πληροφορίες των απέραντων τόμων αυτό το γονίδιο και να πάρουμε και κάνα βαθμό παραπάνω βρε αδερφέ. Όντως, η πλειοψηφία των ερευνητών, ιδιαίτερα των νέων, είναι επηρεασμένοι άμεσα από τα video games.



Τα video games έχουν μπει με τρελές ταχύτητες στη ζωή και στη καθημερινότητα μας και το gaming τα τελευταία χρόνια έχει μαζικοποιηθεί με φρενήρεις ρυθμούς. Οι κύριοι λόγοι είναι ότι πλέον, σχεδόν κάθε σπίτι έχει από έναν υπολογιστή, τα μέλη του facebook και γενικά του social networking κοντεύουν το δισεκατομμύριο, ο καθένας μπορεί να έχει πρόσβαση στο internet ανά πάσα στιγμή στο μετρό, στις βιβλιοθήκες, στο δρόμο, και η αγορά των games έχει αυξήσει τα όρια ηλικίας της στο έπακρο και τη θεματολογία της στο άπειρο. Και με αυτό τον τρόπο έχουν εισβάλει σε όλους του τομείς, από την τηλεόραση και το κινηματογράφο, μέχρι τη μουσική, το lifestyle, ακόμα και την επιστήμη. Στη σύγχρονη επιστήμη δε, η συμβολή των games και των gamers είναι πραγματικά ουσιαστική και αποτελεσματική. Και δεν εννοώ ότι κάποιος θα βρεi ξαφνικά ένα σπάνιο συνένζυμο και θα το ονομάσει Ezio Auditore. Το gaming είναι πλέον ένα σημαντικό εργαλείο που δεν περιορίζεται σε… βαφτίσια.

Αναλύοντας το DNA με video game chips
Η κοινότητα των video gamers έχει όλο και μεγαλύτερες απαιτήσεις από τους κατασκευαστές στις ταχύτητες, στην επεξεργασία δεδομένων, στην απεικόνιση κλπ. Απαιτεί συνέχεια όλο και πιο αποδοτικά τσιπ γραφικών αιχμής, συγκεκριμένα Graphics Processing Units ή GPUs -ένας όρος που επινοήθηκε από το γίγαντα των τσιπ που λέγεται Nvidia. Οι GPUs, μπορεί να γεννήθηκαν για τα επιτραπέζια PC μας, σήμερα όμως χρησιμοποιούνται σε κάθε λογής υπερυπολογιστές που ανήκουν σε οικονομικά ιδρύματα, κυβερνητικές οργανώσεις (για το εξωτερικό μιλάμε πάντα!) και καλούνται κάθε λεπτό να επεξεργαστούν τεράστιες ποσότητες δεδομένων. Το μεγαλύτερο κέντρο αλληλούχισης γονιδιώματος στον κόσμο (ανάλυσης DNA) κάποτε χρειαζόταν 4 ημέρες για να αναλύσει τα δεδομένα ενός ανθρώπινου DNA. Τώρα χρειάζεται μόνο έξι ώρες.



Το BGI -ένα από  τα μεγαλύτερα εργαστήρια με έδρα τo Shenjen, Κίνα- το προηγούμενο φθινόπωρο εφοδιάστηκε με servers που χρησιμοποιούν GPUs by Nvidia και ελαχιστοποίησε τον επίπονο χρόνο ανάλυσης από 96 σε 6 μόνο ώρες. Χαράς ευαγγέλια για ολόκληρο τον κόσμο της Ιατρικής, αφού κάτι τέτοιο υπόσχεται μεγάλη ώθηση στην βιολογική έρευνα, στην μελέτη των ασθενειών και στην θεραπευτική εξατομίκευση - την προσαρμογή δηλαδή φαρμάκων και θεραπειών στο γενετικό προφίλ του καθένα με στόχο την μεγαλύτερη αποτελεσματικότητα τους.

Ο gamer, phyloς της επιστήμης
Όχι δεν πρόκειται για γραμματικό λάθος, παρά για ένα online game των τελευταίων 2 χρόνων που μετατρέπει τον κάθε επίδοξο casual gamer σε γενετιστή. Ο λόγος για το phylo, ένα παιχνίδι που αναπτύχθηκε επειδή, όπως λέει και ένας από τους δημιουργούς του, Dr Jerome Waldispuhl του Πανεπιστήμιο McGill, «…υπάρχουν κάποια πράγματα που άνθρωποι κάνουν καλύτερα από τους υπολογιστές, όπως το να λύνουν παζλ». Είναι αλήθεια ότι οι υπολογιστές έχουν πολύ κακή φήμη στο να αναγνωρίζουν μοτίβα.
Στο εν λόγω παιχνίδι, ο gamer καλείται να μετακινήσει κομμάτια τεσσάρων χρωμάτων -τα οποία αναπαριστούν τα τέσσερα νουκλεοτίδια του DNA- ώστε να εντοπίσει την καλύτερη δυνατή ευθυγράμμιση ανάμεσα σε τμήματα γενετικού υλικού δύο διαφορετικών ειδών. Αυτά τα τμήματα στην ουσία αποφασίζουν ποια κομμάτια του γενετικού υλικού θα καταλήξουν ως γνωρίσματα στον οργανισμό, από τα ξανθά μαλλιά και τα μπλε μάτια μέχρι και τις καρδιοπάθειες. Το αποτέλεσμα του παιχνιδιού βοηθάει τους γενετιστές να εντοπίσουν τις πηγές γενετικών ανωμαλιών. Αν μια γενετική περιοχή έχει διατηρηθεί σε διαφορετικούς οργανισμούς έχει κάποιο συγκεκριμένο λόγο. Έτσι λοιπόν, μπορούμε να κατανοήσουμε καλύτερα το λόγο που μια μετάλλαξη στο DNA δημιουργεί μια ασθένεια ή γιατί εμφανίζεται η κάθε ασθένεια γενικότερα.



Το εντυπωσιακό του πράγματος είναι ότι μόνο τον πρώτο χρόνο λειτουργίας του phylo οι ερευνητές έλαβαν περισσότερες από 350.000 λύσεις σε προβλήματα ευθυγράμμισης αλληλουχιών του γενετικού υλικού. Το phylo έχει βοηθήσει στην κατανόηση της λειτουργίας 521 γονιδίων που σχετίζονται με το Alzheimer, τον διαβήτη και τον καρκίνο και συνεχίζει την ανοδική του πορεία. Η κοινότητα του phylo μεγαλώνει όλο και περισσότερο, έχει σελίδα στο facebook και η ομάδα ανάπτυξης στοχεύει σε εκδόσεις για κινητά και tablets.

Λύνοντας τον γρίφο του AIDS
Έτσι λοιπόν, το online gaming εκτός από διασκεδαστικό μπορεί να γίνει και ιδιαίτερα παραγωγικό. Εκτός από το phylo, ακόμα ένα science online game έχει κάνει την παρουσία του αισθητή τα τελευταία χρόνια, που όμως δεν έχει στόχο τις γενετικές μεταλλάξεις, αλλά τις πρωτεΐνες και τον τρόπο που αναδιπλώνονται στη φύση. Το συγκεκριμένο παιχνίδι αναπτύχθηκε από το Πανεπιστήμιο της Washington, λέγεται Foldit, η beta έκδοση του κυκλοφόρησε το Μάιο του 2008 και έχει 240.000 εγγεγραμμένους χρήστες. Με μια γκάμα από ειδικά όργανα που παρέχονται από το game, ο χρήστης αναδιπλώνει σε 3D απεικόνιση μοντέλα πρωτεϊνών τα οποία αργότερα λαμβάνουν οι επιστήμονες και δοκιμάζουν αν υπάρχουν και μπορούν να αντεπεξέλθουν στην πραγματική ζωή.



Τι γίνεται όμως όταν ο μαθητής ξεπερνάει το δάσκαλο; Γιατί οι μη -επιστήμονες online gamers του Foldit κατάφεραν κάτι που κανείς δεν μπορούσε να φανταστεί. Μέσα σε τρεις εβδομάδες οι χρήστες αποκρυπτογράφησαν τη μοριακή δομή μιας πρωτεΐνης- κλειδί που ο HIV (ιός του AIDS) χρειάζεται για να πολλαπλασιαστεί, κάτι που οι βιοχημικοί του πλανήτη προσπαθούσαν για πάνω από μία δεκαετία! Αυτή η ανακάλυψη αποτελεί τεράστιο βήμα στη δημιουργία φαρμάκων για την εξάλειψη της ασθένειας του AIDS. Αξίζει να αναφερθεί ότι οι επιστήμονες προσέφεραν επιστημονικά δικαιώματα σε κάθε χρήστη που βρήκε τις «σωστές απαντήσεις» για αυτήν την ανακάλυψη, κάτι που οι τελευταίοι αρνήθηκαν. Αντ’ αυτού, οι χρήστες ζήτησαν την αναγνώριση των ομάδων τους: Foldit Contenders Group και Foldit Void Crushers Group. Το μεγαλείο της άμιλλας των gamers, αν ρωτάτε τον γράφοντα.



Παίξε games, σώσε τον κόσμο!
Την επόμενη φορά λοιπόν που θα πάτε να φυτέψετε ηλεκτρονικές ντομάτες ή θα σκάσετε πολύχρωμες μπουρμπουλήθρες απλά για να περάσει η νεκρή ώρα του γραφείου, κάντε ένα πέρασμα από τα science games, ίσως μια μεγάλη ανακάλυψη να είναι μερικά κλικ μακριά. Είναι πραγματικά απίστευτο πόσα μπορεί ένα τόσο όμορφο χόμπι όπως το gaming να προσφέρει στη σύγχρονη επιστήμη, από πλευράς τεχνολογίας και τεχνογνωσίας μέχρι και έρευνας. Ο κάθε gamer μπορεί εύκολα να γίνει μέρος ενός παγκόσμιου επιστημονικού project. Και αυτά είναι μόνο λίγα από τα παραδείγματα και τους τρόπους που μπορούμε να δράσουμε για το καλό της ανθρωπότητας (όσο βαρύγδουπη κι αν ακούγεται η φράση αυτή). Ποιος μπορεί να φανταστεί τι μας επιφυλάσσει το μέλλον; Gamers όλων των χωρών, ενωθείτε!


Η CD Projekt RED δεν έχει ανακάμψει πλήρως από το λανσάρισμα του Cyberpunk 2077

 
*